上海生科院受邀撰写长非编码RNA综述论文

发布时间:2019-09-23  栏目:科技中心  评论:0 Comments

为庆祝建刊40周年,国际期刊Trends Biochem Sci 邀请全球范围内Emerging
Experts介绍他们在各自研究领域的进展及未来发展方向(Series: Fresh
Perspectives from Emerging
Experts)。中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所研究员陈玲玲受邀发表综述论文“Linking
long noncoding RNA localization and function
(doi:10.1016/j.tibs.2016.07.003),并接受杂志专访“Ling-Ling Chen:
Linking Long Noncoding RNA Processing and Function to RNA Biology
(doi:10.1016/j.tibs.2016.07.006),两篇文章分别于8月4日和7月26日在线发表。

6月16日,中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所研究员陈玲玲与计算生物学研究所研究员杨力受邀在Trends
Genet
发表了题为The Diversity of Long Noncoding RNAs and Their
Generation
的综述论文,系统总结了长非编码RNA的多样性及其加工成熟机制。

长非编码RNAs是一类庞大的RNA家族,包含多种多样的分子形式,并且以多种方式参与基因表达调控。很多lncRNAs像信使RNA一样,由RNA聚合酶II转录,经过剪接加工,形成具有5’端m7G帽子和3’端poly尾巴的成熟RNAs。但是与mRNAs不同的是,mRNAs大多数在加工成熟的过程中被转运到细胞浆中然后被翻译成蛋白质;而很多lncRNAs则需要定位在细胞核内特殊的位置来发挥其调控功能。决定lncRNAs特殊的细胞核内定位的分子机制尚不清楚;同时,那些定位于细胞浆中的lncRNAs如何与mRNAs区分从而不被核糖体机器翻译的机制还有待研究。陈玲玲围绕这些长非编码RNA研究领域的关键科学问题,对已有的研究工作做了简要总结,并提出lncRNAs发生细胞核滞留以及特殊核定位的几种可能分子机制。阐明这些长非编码RNA细胞命运决定多样性的分子机制,将为揭示这一庞大分子家族的加工成熟和生物学功能提供重要线索。

基因组中存在大量被称为基因组“暗物质”的非编码区域,这些区域能转录产生各种类型的lncRNAs。启动子、增强子区域能转录产生长度在200-2000
nt的lncRNAs,包括PROMPTs
和eRNAs等。基因间非编码区域转录产生的lincRNAs像mRNAs一样,经过剪接加工,形成具有5’端m7G帽子和3’端poly尾巴的成熟RNAs。此外,还有一些lncRNAs不具有5’端m7G帽子和3′
端poly尾巴的结构,这些lncRNAs的产生与真核生物RNA的加工成熟过程紧密相关。例如核酶介导形成的3’端具有三螺旋结构的MALAT1等lncRNAs;来自内含子、两端有小核仁RNA和蛋白质复合物保护的sno-lncRNAs;来自多顺反子转录本、具有5’端snoRNA帽子和3’端poly尾巴结构的SPAs;以及来自内含子通过关键核酸序列成环的ciRNAs和通过外显子反向剪接成环的circRNAs。发表在Trends
Genet
上的这一特邀综述论文,主要对上述多种长非编码RNA的加工生成和代谢机制进行了总结和展望。陈玲玲的博士研究生吴煌是该文的第一作者。

此外,陈玲玲也接受了Trends Biochem Sci
同期专访,介绍了她从事长非编码RNA科研经历以及发现几类全新非编码RNAs分子家族的研究历程。

陈玲玲研究组致力于长非编码RNA和环形RNA的代谢机制与功能作用研究,杨力研究组专注于转录组RNA计算生物学研究。两个研究组通过合作系统揭示了多种新型长非编码RNA分子家族,并全面揭示了这些特殊分子结构非编码RNA生成加工的新机制及其潜在的重要生物学功能,极大地推动了长非编码RNA研究领域的发展。相关研究获得了国家自然科学基金、科技部以及中科院等的经费支持。

综述论文链接

文章链接

留下评论

网站地图xml地图